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南京古生物所研发大型化石表面元素分析仪器近期，中国科学院南京地质古生物研究所王伟研究员团队研发的“非破坏性立体化石及文物表面化学元素分布特征分析方法”获得国家发明专利授权（授权公告号:CN111624218B）。
近期，中国科学院南京地质古生物研究所王伟研究员团队研发的“非破坏性立体化石及文物表面化学元素分布特征分析方法”获得国家发明专利授权（授权公告号:CN111624218B）。
我们常见的化石多为硬体骨骼化石，软躯体化石可以提供更多生物信息，但由于生物死亡后腐败降解等原因通常难以保存。然而，软躯体在降解过程中会释放不同类型的有机物，这些有机物与周围的沉积物发生反应，往往会在化石周围的岩石中留下一些化学元素信息。
此前通常用电子显微镜的能谱（EDS）或同步辐射X射线荧光光谱（SXRF）检测化石表面的化学元素分布。这些分析需要将样品-X射线光源-探测器（简称“样-源距离”）之间的距离保持一致，才能获得化石形状和元素浓度的综合图像。如果开展一定面积的检测，就需要将化石及围岩磨成平面（或不断调整样品位置，这几乎很难实现），才能保持“样-源距离”不变。但磨平这种破坏性方法对于重要化石来说是难以接受的，因此无损伤检测手段亟待探寻。
王伟团队此次新研发的三维X射线荧光扫描仪，是通过建立化石及其围岩表面的空间数学模型、实时移动检测器和X射线光源的空间位置，实现它们与化石及围岩表面保持同等距离。该方法克服了化石及围岩立体表面对分析结果的干扰，同时也避免了样品需要磨平带来的损害。
此外，该扫描仪还增加了惰性气体喷气口，可以降低大气中的氧气、氮气对测量结果的影响，使得测量环境可与真空媲美；激光漫反射能量检测反馈系统可以实现非光滑表面的精准检测，从而使大型化石表面化学元素分布的无损测量成为可能。
三维X射线荧光扫描仪的研发为古生物学-地质学研究提供了新工具，也可以为文物等相关领域开展元素级样品鉴定提供参考。
该项目得到了中国科学院、国家自然科学基金委、现代古生物学和地层学国家重点实验室经费支持。
三维X射线荧光扫描仪
通过三维X射线荧光扫描仪对贵州龙化石进行检测并得到元素分布示意图。其中，左边为待测样品贵州龙化石，右边为Ca元素含量分布图，元素含量越高，则在图中显示的颜色越深。2023-01-16 -
研究揭示南京花子房内有被包裹的胚珠近日，中国科学院南京地质古生物所王鑫研究员、傅强研究员等利用微CT技术穿透南京花化石材料、揭示了肉眼无法直接观察到的化石内部结构。相关研究结果于2023年1月9日发表在英国自然出版集团《科学报告》（Scientific Reports）上。
被子植物既给人类提供了重要的生活资料，其美丽的花朵也给平凡的世界增添了几分美丽。植物学家一直在寻找最早的被子植物花朵、探索被子植物的起源和历史。古植物学家长期认为，白垩纪之前没有被子植物。2018年，最古老的花朵化石南京花（Nanjinganthus）的发现则打破了这种观点。南京花保存于1.74亿年前的早侏罗世地层，比白垩纪还要再早大约5千万年，引起了国际上的广泛关注和热烈争论。
近日，中国科学院南京地质古生物所王鑫研究员、傅强研究员等利用微CT技术穿透南京花化石材料、揭示了肉眼无法直接观察到的化石内部结构。相关研究结果于2023年1月9日发表在英国自然出版集团《科学报告》（Scientific Reports）上。
在2018年的文章中，由于当时的技术手段只能看到破开的子房中的胚珠，封闭子房中是否有胚珠无从得知。因此，此前的研究结果中显示的南京花胚珠和封闭子房这两个结构并不是在同一朵花化石中看见的，由此也引发了一系列争议。
此次科研团队对三维保存的南京花炭化压型标本进行了Micro-CT研究，成功观察到了南京花封闭子房内部保存的胚珠——而这正是被子植物的关键特征。该发现再次明确了南京花的被子植物属性，也确认了被子植物在侏罗纪的存在，有助于进一步理清对被子植物早期历史的认识。
本研究得到了国家自然科学基金委、中科院战略性先导科技专项（B类）的支持。
论文相关信息： Fu, Q., Hou, Y., Yin, P. et al. Micro-CT results exhibit ovules enclosed in the ovaries of Nanjinganthus. Sci Rep 13, 426 (2023). https://doi.org/10.1038/s41598-022-27334-0.
南京花子房内被包裹的胚珠
南京花的复原图2023-01-10 -
内蒙古白垩纪球果状花朵解剖学研究新进展在早白垩世已经发现了多种早期的花（被子植物的生殖器官），但其中大多数缺乏解剖学细节。这使得现存的被子植物和化石之间留有很多未知之谜。中国科学院南京地质古生物研究所王鑫研究员，与西班牙比戈大学及澳大利亚昆士兰标本馆开展国际合作，利用石蜡切片技术深入研究了来自内蒙古早白垩世植物化石的生殖器官。相关研究结果近日发表在瑞士出版的学术期刊《生命》（Life）。
在早白垩世已经发现了多种早期的花（被子植物的生殖器官），但其中大多数缺乏解剖学细节。这使得现存的被子植物和化石之间留有很多未知之谜。中国科学院南京地质古生物研究所王鑫研究员，与西班牙比戈大学及澳大利亚昆士兰标本馆开展国际合作，利用石蜡切片技术深入研究了来自内蒙古早白垩世植物化石的生殖器官。相关研究结果近日发表在瑞士出版的学术期刊《生命》（Life）。
此次研究的这枚距今约一亿年的化石来自内蒙古锡林浩特胜利煤矿，研究人员将其命名为胜利锡林花（Xilinia shengliensis）。胜利锡林花极易被认为是裸子植物球果，但通过使用石蜡切片技术研究，发现其胚珠是被包裹的。在古植物学研究中，人们进行解剖学研究通常是通过磨片来实现，这种手段在技术好的情况下，用1毫米的材料可以获得一个切片。此次研究中使用的石蜡切片技术则允许从1毫米的材料获取100个切片。
胜利锡林花生殖器官的解剖学细节表明，虽然在一般形态上类似于裸子植物球果，但它的胚珠是封闭的，后者的特征到目前为止只限于被子植物。因此，胜利锡林花可能代表了被子植物进化史中的一个过渡性化石。
研究得到了中国科学院和国家自然科学基金的资助。
论文相关信息：Wang, X.; Diez, J.B.; Pole, M.; García-ávila, M. An Anatomically Preserved Cone-Like Flower from the Lower Cretaceous of China. Life 2023, 13, 129. https://doi.org/10.3390/life13010129.
胜利锡林花及其细节
胜利锡林花的花被片、心皮和花轴的细节
胜利锡林花的复原图2023-01-04 -
寒武纪生物古地理格局与多样性演变的耦合关系研究基于PBDB数据库（https://paleobiodb.org）中4万余条寒武纪无脊椎动物化石产出记录数据，结合网络分析法，对此关键时期的生物古地理格局进行了深入剖析，并探讨寒武纪大爆发及随后的若干次规模不一的生物灭绝事件是如何在全球尺度上对上述格局造成影响。
寒武纪是海洋生物与环境协同演化的关键时期，记录了地质历史中最重要的生物演化事件之一。在这一时期几乎所有的动物门类相继出现，并在相对较短的一段时期内(距今5.6-5.2亿年前)，发生了快速的生态分化和扩张，从而奠定了显生宙以来海洋生态系统的基础。
这一生物事件已被诸多学者广泛研究并深入讨论，并通过将多样性分解为alpha、beta和gamma三个不同尺度；一些研究还揭示了寒武纪大爆发本质上主要是由群落间多样性在第二阶向第三阶过渡期间的快速增长所驱动的。然而，在此过程中，地区间不同群落的分化究竟如何表现在地理空间上，即生物古地理的具体演变模式，一直缺乏基于多门类古生物数据的定量化评估。
近期，中国科学院南京地质古生物研究所地层古生物大数据中心副主任那琳博士、现代古生物学和地层学国家重点实验室李启剑副研究员，与德国埃尔朗根-纽伦堡大学的科研人员合作，基于PBDB数据库（https://paleobiodb.org）中4万余条寒武纪无脊椎动物化石产出记录数据，结合网络分析法，对此关键时期的生物古地理格局进行了深入剖析，并探讨寒武纪大爆发及随后的若干次规模不一的生物灭绝事件是如何在全球尺度上对上述格局造成影响。相关成果近期发表在国际理论古生物学权威期刊《古生物学》（Paleobiology）上。
研究发现，基于种级分类单元的网络组成显示，在寒武系的前三阶表现为全球生物地理有地区性逐渐加强的趋势，并在第四阶到达辐射期峰值（图1）；海洋生物的平均分布范围则随着时间的推移逐渐收缩，移动能力较强的古生物化石产出记录比例亦在此期显著增加。上述结果不但从生物古地理的角度验证了寒武纪大爆发全球多样性的增长主要是由beta多样性驱动的假说，而且详细勾勒出每个阶生物区演变的细节（图2），暗示了生物地理区域性的增强可能进一步加速了全球多样性的增长。而在古杯动物灭绝事件（AECE）的发生之后，伴随着全球生物区的高周转率，乌溜期的生物古地理格局也几乎被完全重置，表明灭绝事件能对生物古地理格局产生至关重要的影响。
相关研究得到了中国科学院战略先导专项、中国科学院青促会项目和国家重点实验室基础课题等的资助。
论文相关信息：Na, L., Kocsis, á, Li, Q.*, & Kiessling, W. (2022). Coupling of geographic range and provincialism in Cambrian marine invertebrates. Paleobiology, 1-12. https://doi.org/10.1017/pab.2022.36.
图1 寒武纪生物古地理地区性指标（PIE）的变化曲线（PIE值越高，表明地区性越强）
图2 基于网络分析法寒武系各个阶的生物古地理格局（不同颜色和数字的多边形代表了不同的生物区）2023-01-03 -
密西西比亚纪中-晚期全球气候变冷导致珊瑚礁系统崩溃研究人员利用腕足类壳体氧同位素、以及生物礁和多门类化石多样性统计，揭示了密西西比亚纪中-晚期气候变冷与珊瑚礁系统崩溃和生物多样性减少的关系。
晚古生代大冰期的起始时间、演化历程、及其对海洋生物演化的影响一直是科学家关注的热点问题。晚古生代大冰期的广泛发育（即冰期主幕）一般认为开始于密西西比亚纪中-晚期（维宪期-谢尔普霍夫期），但基于高纬度冰川沉积、低纬度海平面变化、化石氧同位素等记录，不同学者对冰期主幕开始时间的认识并不一致，观点包括：维宪晚期、维宪期-谢尔普霍夫期之交、谢尔普霍夫早期、谢尔普霍夫晚期。
另外，前人研究发现密西西比亚纪中-晚期发生了一次显著的生物灭绝事件，导致约39%属级别的海洋无脊椎动物灭绝，这次生物灭绝还伴随显著的古生态变化，排在显生宙所有生物灭绝中的第5位；最近研究发现，维宪晚期存在全球珊瑚礁繁盛，谢尔普霍夫期珊瑚礁丰度显著降低。因此，目前关于密西西比亚纪中-晚期气候变化过程及其与海洋珊瑚礁丰度和生物多样性变化关系的认识还不清楚。
中国科学院南京地质古生物研究所晚古生代研究团队要乐副研究员等人，与美国内华达州立大学拉斯维加斯分校蒋干清教授，台湾师范大学米泓生教授，法国图卢兹第三大学Markus Aretz教授，南京大学王向东教授共同合作，利用腕足类壳体氧同位素、以及生物礁和多门类化石多样性统计，揭示了密西西比亚纪中-晚期气候变冷与珊瑚礁系统崩溃和生物多样性减少的关系。相关研究成果发表在地学领域国际知名期刊《全球和行星变化》（Global and Planetary Change）上。
该研究选取了华南出露连续、生物地层详实、且富含腕足类化石的贵州雅水剖面和广西甘垌子剖面，有孔虫生物地层确定剖面的时代为密西西比亚纪维宪晚期-谢尔普霍夫期。首先对采集的腕足类化石进行属种鉴定，之后对腕足类壳体进行扫描电镜、阴极发光、主微量元素等分析，最后选取结构保存好、未明显经受后期成岩改造的腕足类壳体进行无机碳、氧同位素测试；另外，对该时期的生物礁丰度，以及珊瑚和有孔虫多样性进行了统计。
研究发现在密西西比亚纪维宪晚期（Asbian-Brigantian之交）腕足类壳体氧同位素存在一次显著正偏，幅度约2‰，其指示该时期古海水温度降低约5℃。维宪晚期这次显著气候变冷事件与高纬度冈瓦纳大陆冰川发育、低纬度海平面降低和高频率旋回地层发育等相一致，它们共同指示这次全球气候变冷可能代表了晚古生代大冰期主幕的开始。同时，这次变冷事件伴随珊瑚礁丰度和底栖生物多样性的明显减少；随着谢尔普霍夫期气候的持续变冷，珊瑚礁丰度逐渐降低，于谢尔普霍夫晚期达到最低值。
通过无机碳、氧、锶同位素变化曲线的对比研究，发现在维宪晚期变冷转折期，锶同位素的正偏早于无机碳同位素，后者早于氧同位素，其指示密西西比亚纪中-晚期的气候变冷可能与大陆风化作用增强导致更多营养元素输入海洋，进而导致海洋初始生产力提高和有机碳埋藏量增加有关。
该论文被评为《全球和行星变化》期刊2022年度最佳论文，共有18篇论文入选，涉及的研究方向包括全球构造（2篇）、地表过程与地貌（4篇）、现代气候系统（2篇）、深时生物演化（2篇）、中生代陆地气候与演化（5篇）以及第四纪古海洋（3篇）。
该研究得到国家自然科学基金委、中科院战略性先导科技专项（B类）和中国科学院青年创新促进会的资助。
论文相关信息：Yao, L. , Jiang G.Q., Mii, H.S., Lin, Y.F., Aretz, M., Chen, J.T., Qi, Y.P., Lin, W., Wang, Q.L., Wang, X.D., 2022. Global cooling initiated the Middle-Late Mississippian biodiversity crisis. Global and Planetary Change, 215, 103852. https://doi.org/10.1016/j.gloplacha.2022.103852.
密西西比亚纪古海水温度与海洋珊瑚礁丰度和生物多样性协同演化关系
腕足类壳体扫描电镜下纤维状（A-C）和棱柱状（A, D）结构
腕足类壳体单偏光（A, C）及其对应的阴极发光（B, D）图片2022-12-26 -
化学地层学全球对比研究的一种新方法及其应用地层划分和对比是地层学也是化学地层学研究的主要任务。中国科学院南京地质古生物研究所王伟研究员团队经过长期探索，提出了化学地层学研究的一种新方法——等时等环境线（Isochronline）研究，用于从混合数据中提取出可全球对比的信息，同时对该方法进行了理论证明，并在二叠系乐平统-瓜达鲁普统界线辅助剖面中进行了验证。
地层划分和对比是地层学也是化学地层学研究的主要任务。中国科学院南京地质古生物研究所王伟研究员团队经过长期探索，提出了化学地层学研究的一种新方法——等时等环境线（Isochronline）研究，用于从混合数据中提取出可全球对比的信息，同时对该方法进行了理论证明，并在二叠系乐平统-瓜达鲁普统界线辅助剖面中进行了验证。研究成果近期发表在国际地学期刊《岛弧》（Island Arc）和《地质学杂志》（Geological Journal）上。
化学地层学是利用沉积物的各种地球化学信号及其在地层中的变化规律，并结合其物源信息和环境意义，对地层进行划分和对比的一种手段。因此，化学地层学通常能够连续采样获得较为完整的信息（生物地层研究中经常会遇到化石缺失的问题），有明确的环境指向，以及完全的定量指标等优势。
然而，化学地层学也同样存在缺陷。任何地方的沉积物均为当地沉积环境、物源区环境和全球事件的混合记录，当进行全球对比的时候，很难知道具体有多少比例的数据是来自当地的，又有多少比例是全球事件叠加的。因此，如何从地方性的环境信息中提取出可以用于全球对比的“纯”信号是关键。
研究团队历经近20年的探索、尝试，提出了“等时等环境线”的研究方法，用于寻找可全球对比的地球化学“纯”信号，并对这些方法进行了沉积学和空间几何方面的证明。
等时等环境线是一组与沉积相无关的化学地层数据，可以通过顺着岩层走向的横向测量或开阔露头的网格化测量（Grid Mapping）等方法获取。与提供沉积环境“混合记录”的传统化学地层数据不同，它可以用来评估全球环境信息。研究团队还介绍了使用哪些分析手段或设备可以简单有效地测量地层剖面、开展样品采集、实现数据可视化，甚至细微到应该采集岩层中的哪个位置的样品。
此外，研究团队还对沉积学和地层学基本原理瓦尔特相律，包括穿时现象等给出了其存在例外的理论证明。此次研究成果给化学地层学研究提供一条新的途径，也在一定程度上给予地层学其他领域一些新的思路。
相关研究得到了中国科学院先导专项B、国家自然科学基金委和科技部等项目资助。
论文参考信息：
Wang, W. (2022). Isochronline in chemostratigraphy for global correlation and an exception of the Walther's law of facies. Island Arc, 31(1), e12470. https://doi.org/10.1111/iar.12470.
Ma, Q., Ye, F., Wang, W*. Sheng, Y., Shu, L., & Chen, X. (2021). Grid mapping revealed hidden geochemical lens and its chemostratigraphic bias in the middle-upper Permian marine carbonate sequence in Laibin, South China. Geological Journal, 56(12), 6088–6101. https://doi.org/10.1002/gj.4156.
图1 用于证明地层中的相关剖面、岩石层面、Isochronline、沉积相等的三维模型。如上图，Isochronline 0和Isochronline 1分别是今天和N年之前某天形成的沉积物的虚拟线。
图2 网格化地层学研究的模型，各种测量剖面及其和Isochronline之间的关系。
图3 剖面上等时间点和Isochronline及岩石横向展布之间的关系模型。我们都在说地层是穿时的，但如何在一个横向延展的岩层上找到纵向剖面上某个点的等时位置，是我们非常关心的问题。
图4 二叠系乐平统-瓜达鲁普统界线辅助层型剖面地球化学地图。很明显，同一层岩石的地球化学特征各有不同。比如，钙和铁这些与沉积环境和物源有关的指标，基本上顺层分布，但碳同位素组成就出现明显的穿层现象。在一些展布很广的剖面上，这种现象，可能是不同研究人员发表的数据存在差异的原因。2022-12-26 -
石板滩生物群发现新的恰尼虫化石研究发现恰尼虫标本与后生动物遗迹化石可以保存在同一层面上（图2.3），说明恰尼虫能够生活于后生动物存在的环境中，这种共存的关系可对造迹生物与埃迪卡拉化石之间的生态相互作用提供了重要的启示意义。
恰尼虫（Charnia）是最具代表性的埃迪卡拉化石之一，在阿瓦隆组合（距今约5.75-5.6亿年前）、白海组合（距今约5.6-5.5亿年前）、纳玛组合（距今约5.5-5.39亿年前）三种面貌不同的埃迪卡拉生物群中都有发现；其也是迄今为止研究得最多的埃迪卡拉化石之一。然而关于恰尼虫亲缘属性、生长发育模式以及生活方式等科学问题至今仍没有一致的结论。
此前，恰尼虫属仅有其模式种梅森恰尼虫(Charnia masoni）一个种。在前人的研究结果中，恰尼虫属曾有其他3个形态种，但是它们随后要么被归入其他的形态属，要么被厘定为模式种的同物异名。因此，人们认为恰尼虫可能在其延续的约三千万年的时间里都保持了较高的形态稳定性。但也有科学家认为是由于恰尼虫化石保存的形态信息有限，使得没有足够的特征数据（尤其是定量的数据）开展种一级别的细分工作。
产自我国湖北三峡地区埃迪卡拉系灯影组灰岩中的石板滩生物群（距今5.5~5.43亿年），是世界上为数不多的产于碳酸盐岩当中的埃迪卡拉生物群。经过十余年的挖掘，中国科学院南京地质古生物研究所早期生命研究团队的科研人员在石板滩生物群中，共计发现了12枚恰尼虫化石标本（图1、2），并展开了详细的研究。相关成果发表在国际知名古生物学期刊《古生物学杂志》（Journal of Paleontology）上。
通过对来自石板滩生物群以及世界各地已发表的恰尼虫标本进行叶状体与各级分枝结构的形态测量，研究发现可将石板滩生物群的标本分为两种类型。一种类型可归入模式种，即梅森恰尼虫（Charnia masoni；图1.1、1.2）；另一种类型则归入本次研究新建立的种——细长恰尼虫（Charnia gracilis new species；图1.3-1.8、2）。
本次研究通过定义一个用于衡量初级分枝弯曲程度的新参数X，系统比较各地标本的参数X以及初级分枝与中线之间的夹角（分枝角度），发现细长恰尼虫与梅森恰尼虫在这两种数据中的平均值分布都有较大差异（图3）。具体而言，细长恰尼虫具有更为细长且笔直的初级分枝，具有较小的分枝角度（≤20°）；而梅森恰尼虫的初级分枝为S形，通常具有相对较大的分枝角度（>20°）。因此，通过详细的形态测量可推测，恰尼虫属不止包含模式种这一种类型，细长恰尼虫可能在此前的研究中被忽略了。
研究发现，来自石板滩生物群的恰尼虫标本还证实了其两阶段生长模式的假说。在石板滩段的材料中，有两个体型较小的叶状化石可视作幼年时期的恰尼虫，它们的初级分枝数量（~10）要明显少于恰尼虫最大的标本（≥26），这说明初级分枝数量的增长是该类生物的一个关键生长方式。另一方面，对于不同的单个标本而言，无论是位于叶状结构顶端还是中下部的初级分枝，其上的次级分枝数量是接近的，但是次级分枝的形状却是随着标本大小而变化，同时次级分枝的面积大小也随着叶状结构的长度而增大（图4）。因此，恰尼虫主要通过前期初级分枝数量上的增长和后期初级分枝体积膨大而增长，而初级分枝的生长主要通过次级分枝体积的膨大实现。
来自石板滩生物群的恰尼虫标本亦表明了这种生物营底栖固着、直立生长的生活方式。尽管恰尼虫被广泛地视作一种底栖生物，对于它在海床上的生长姿势却存在不同观点。一些学者认为恰尼虫是倒伏在海底上生长的，认为它们可能具有背、腹两面，而化石保存下来的总是同一面；而更多学者则认为恰尼虫营固着直立生活。此次在石板滩生物群中发现了一枚恰尼虫标本，其具有一个扭曲的茎（图1.1），这很可能是该生物个体死前被水流影响所导致，从侧面证明了恰尼虫营固着直立生长的观点。
恰尼虫具有固着器的这一特点也与固着直立的生长习性相符合，虽然恰尼虫保存固着器的相关化石证据很少。石板滩生物群中有两枚恰尼虫标本保存了固着器结构（图1.1、1.7），尤其是上述具扭曲茎的恰尼虫标本，有一个较大的圆盘状固着器，固着器上发育有丝状结构。这可能是在水流作用下，大的固着器从沉积物中被拔出所造成的，这个解释与该标本具有扭曲的茎以及石板滩段周期性的风暴沉积环境相一致。因此，石板滩生物群的标本，支持恰尼虫营固着直立的方式生长，而非倒伏生长于海床上。
此外，研究还发现恰尼虫标本与后生动物遗迹化石可以保存在同一层面上（图2.3），说明恰尼虫能够生活于后生动物存在的环境中，这种共存的关系可对造迹生物与埃迪卡拉化石之间的生态相互作用提供了重要的启示意义。
此次石板滩生物群中恰尼虫的发现，不仅进一步丰富了该生物群的整体面貌，而且表明该生物群是世界范围内最年轻的恰尼虫化石产地之一。研究扩大了恰尼虫的古地理及古环境分布，表明恰尼虫是地层延限最大（距今5.74-5.39亿年间，跨越了约三千万年的地球历史）、地理分布最广（分布于各个不同古纬度的古板块上，图5）的埃迪卡拉生物之一，它几乎见证了整个埃迪卡拉生物群的兴衰历史。
本研究得到国家自然科学基金、中国科学院、科技部国家重点研发计划青年科学家项目、中科院青促会、现代古生物学和地层学国家重点实验室的联合资助。
论文相关信息： Wu, C., Pang, K.*, Chen, Z.*, Wang, X., Zhou, C., Wan, B., Yuan, X., Xiao, S. 2022. The rangeomorph fossil Charnia from the Ediacaran Shibantan biota in the Yangtze Gorges area, South China. Journal of Paleontology. https://doi.org/10.1017/jpa.2022.1097.
图1 石板滩生物群中的梅森恰尼虫Charnia masoni（1, 2）以及细长恰尼虫Charnia gracilis n. sp.（3–8）
图2 石板滩生物群中的细长恰尼虫Charnia gracilis n. sp.
图3 对石板滩生物群中的恰尼虫与世界范围内其他恰尼虫标本统计所得出的散点图（1-7），以及测量标准示意图（8、9）
图4 对来自石板滩生物群中保存有完整次级分枝数量的细长恰尼虫Charnia gracilis n. sp.进行统计得出的散点图
图5 恰尼虫的古地理分布图2022-12-14 -
FossilMorph：化石自动测量和定量分析的新工具
大数据与人工智能是驱动地球科学研究范式革新的重要手段。其在古生物学研究中也有着越来越多的应用，如利用卷积神经网络进行化石图像的智能识别分类、采用数字图像处理技术进行化石形态特征数据的自动获取和分析等。
随着古生物化石样品采集精度的提高和科研与生产实践中对样品分析更加高效的需求，科研人员通常需要在较短时间内处理大量化石图像。其中对其进行形态学特征的测量与分析是图像处理的主要工作之一。目前化石的形态学数据主要依赖于手动操作测量软件，如Image J等。这样不仅繁琐耗时，而且具有一定的主观性，容易产生人为误差。
近期，中国科学院南京地质古生物研究所早期生命研究团队的万斌副研究员指导硕士研究生郑文涛，与东南大学、上海交通大学、南京大学的研究人员合作，设计开发了一款化石图像测量分析的可视化操作界面—“FossilMorph”工具软件。该软件可用于进行化石图像形态特征的自动测量和定量分析。研究成果近期发表于地学期刊《远古世界》（Palaeoworld）。
该软件版本主要是基于OpenCV-Python快速图像处理的计算机视觉工具，使用了多种图像处理技术，包括灰度转换、图像滤波、图像二值化、连通域分析等，并采用了OCR字符识别技术对化石图像比例尺进行自动识别以及换算，实现了对椭球形、丝状体、部分破损等类型的有机壁微体化石形态特征进行自动化批量提取和定量分析。分析结果可以Excel数据（.xlsx格式）导出或以箱线图、散点图、直方图、聚类图等多种类型图件呈现。
该软件的应用可大幅节省科研人员的时间与精力，明显提升化石图像形态特征的数据化和准确率。目前批处理模式可在1分钟内完成2000个化石图像形态数据的采集和分析。该技术在一定程度上表明了数字图像处理技术在有机质壁微体化石研究中具有很大潜力。
目前，该软件版本对于个体保存、形态相对简单、且主体与背景对比强烈的化石图像（如光学显微镜下的孢粉和疑源类酸蚀处理的薄片照片）具有较好的处理效果。未来随着算法的创新，FossilMorph将不断优化，致力于处理形态更为复杂的化石类型和集群保存化石组合等，并与卷积神经网络应用相结合，依据化石定量化的形态和结构特征，进行化石图像的智能识别和定量分析，从而挖掘化石背后的更多真实有效数据信息，为揭示生命演化提供数据支撑。
相关软件已申请中国版权保护中心的计算机软件著作权。
该研究受到国家自然科学基金项目、中国科学院先导专项B类和前沿重点部署项目、现代古生物学与地层学国家重点实验室项目、香港特别行政区博士后奖学金联合资助。
论文相关信息：Zheng Wentao#, Lou Zhouwei#, Yu Yefeng, Tang Qing, Wang Xiaopeng, Zhao Xianye, Shi Hongyi, Wan Bin*. FossilMorph: A new tool for fossil automatic measurement and statistical analysis. Palaeoworld. 2022. https://doi.org/10.1016/j.palwor.2022.11.001.
图1 FossilMorph数字图像处理流程图
图2 丝状体类型的算法示意图
图3 FossilMorph单图处理模式（A）和批量处理模式（B）界面截图
图4 FossilMorph数据定量分析的图件展示2022-12-09 -
华北板块早寒武世膏盐沉积研究取得新进展研究系统总结了华北板块寒武纪早期膏盐沉积的地理分布范围及地层赋存特征，并探讨其对应的事件地层学、古地理学和古环境意义。
膏盐沉积通常形成于中低纬度地区的封闭、半封闭沉积环境中，是干旱气候和蒸发相环境的敏感沉积物，具有重要的事件地层学、古地理学和古环境指示意义。寒武纪早期是地质历史中一次大规模的膏盐沉积期，在华北板块寒武系下部地层中就广泛发育有膏盐沉积，这为探讨含膏盐沉积地层的时代，以及该时期华北板块的古地理位置和古环境变化提供了实证材料。
近期，中国科学院南京地质古生物研究所早期生命研究团队的万斌副研究员指导硕士研究生郑文涛，与南京大学科研人员合作，系统总结了华北板块寒武纪早期膏盐沉积的地理分布范围及地层赋存特征，并探讨其对应的事件地层学、古地理学和古环境意义。相关成果近期发表在国际地学专业期刊《亚洲地质》（Journal of Asian Earth Sciences）上。
研究发现，华北板块寒武系广泛分布的主要是浅水台地相碎屑岩-碳酸盐岩组合，下寒武统地层具有“两灰加两红”的沉积模式。膏盐沉积主要发育在下寒武统的两套红色岩系中，表现为石膏、石盐假晶和膏溶角砾岩等。膏盐沉积的地理分布，集中在华北板块东缘的胶辽徐淮地区和南缘晋陕豫交界区，并在东北缘的辽宁太子河-浑江流域地区和南缘的豫西地区形成两个沉积中心。综合生物地层学、化学地层学和碎屑锆石年代学等证据，表明华北板块这两套膏盐沉积的确切时代为早寒武世都匀期（514-509 Ma），推测该时期发生了重要的干旱事件，可以作为准确限定含膏盐沉积时代的地层对比标志。
膏盐沉积的形成还与所处的纬度密切相关。现代膏盐沉积主要呈带状分布在南北纬30°附近，地史上蒸发岩沉积的古纬度也大都分布这个区间。因此，在总结早寒武世膏盐沉积地理分布特征的基础上，结合最新的古地磁、生物古地理和沉积物源等证据，本次研究认为华北板块在都匀期的地理位置是位于北纬20°- 30°之间，贴近冈瓦纳大陆西缘，主体呈北西-南东向展布。
寒武纪早期是后生动物起源和演化的关键时期，发生过两次生物灭绝事件，分别是古杯动物大灭绝事件（AECE）以及莱德利基虫类和小油栉虫类大灭绝事件（ROECE）。本次研究发现，华北板块寒武纪早期膏盐沉积和这两次大灭绝事件在时空关系上具有较高的耦合性，进而推测膏盐沉积所代表的多期海退和高温干旱事件，导致了海水盐度的增加和底栖动物栖息地的丧失，可能是造成以古杯动物和莱德利基虫等为代表的底栖生物灭绝的重要环境因素。
本研究得到科技部重点研发计划、国家自然科学基金、中国科学院、现代古生物学和地层学国家重点实验室的联合资助。
论文相关信息：Zheng Wentao, Wang Xiaopeng, Wan Bin*, Pang Ke, Tang Qing. Journal of Asian Earth Sciences. 2023 242:105489. https://doi.org/10.1016/j.jseaes.2022.105489.
图1 华北板块早寒武世膏盐沉积的地层分布
图2 华北板块早寒武世古地理位置恢复（514-509 Ma）
图3 华北板块早寒武世膏盐沉积与生物-环境演化事件综合图2022-12-07 -
西北太平洋地区末次冰期北极物种的南移本次研究对于理解西北太平洋地区在末次冰期的古生态古环境演化有重要意义，对于了解海洋生物对环境变化的响应以及人为和气候变化导致的极地物种迁移具有重要的参考价值。
东亚冬季风作为亚洲季风系统的重要组成部分，对东亚地区气候和环境演变具有重要影响。然而，东亚冬季风气候动力学对海洋生物的影响并未引起足够的关注。西北太平洋地区凭借着其重要的地理位置及其对气候变化的敏感性，成为研究全球变化和古季风演化的理想场所。
由中国科学院南京地质古生物研究所、河海大学、美国史密森尼国家自然历史博物馆和香港大学组成的国际研究团队，在黄海和日本海选取了8个站位，重建了该区域在末次冰期北极介形虫的时空分布。研究将有助于深入理解北极物种的生物地理分布格局及其对气候变化的响应机制。相关研究成果于近期发表在《地球物理研究通讯》（Geophysical Research Letters）。
研究团队在南黄海YSZK-1站位的沉积物柱状样中发现33属43种介形虫。通过非度量多维尺度分析（non-metric multidimensional scaling），将这些介形虫分为三个组合，分别为：主要分布于北极区域的介形虫组合、温带和亚热带介形虫组合以及冷水介形虫组合；而这些北极介形虫和冷水介形虫分别出现在两次不同的时间段。通过与南黄海其他站位及日本海IODP U1427站位等的对比分析，并结合AMS 14C测年结果和光释光测年结果，研究人员首次确定了北极介形虫出现在黄海的时间，即第一次出现在12万至10万年前，第二次的时间为3万至1.5万年前。
北极介形虫的出现在黄海一直被用于指示古冷水团的存在。目前冷水团主要分布于黄海中央海槽附近，平均深度44米，温度小于10℃且盐度范围在32-33‰之间。这些深度、温度和盐度范围实际上也符合所发现的北极介形虫生活的舒适环境，然而现今在黄海水体中只发现了一种主要栖息于北极附近的介形虫。
研究人员进一步比较现今黄海和北极海域的环境情况后，认为末次冰期北极介形虫在黄海的两次出现事件意味着增强的且温度更低的古冷水团的存在。此外，前人研究也证实，强东亚冬季风会促进黄海冷水团的形成，并进一步影响西北太平洋地区的海洋生态系统。而东亚冬季风增强的时间，也与北极介形虫出现在黄海的时间相吻合。因此，研究人员认为强东亚冬季风在12万至10万年前和3万至1.5万年前出现，促进了黄海古冷水团的形成并降低黄海冬季的水体温度，从而使北极介形虫能够向南栖息至黄海海域。
本次研究对于理解西北太平洋地区在末次冰期的古生态古环境演化有重要意义，对于了解海洋生物对环境变化的响应以及人为和气候变化导致的极地物种迁移具有重要的参考价值。
南京古生物所王贺博士和香港大学Moriaki Yasuhara副教授为论文的通讯作者，河海大学张鹏辉副教授和美国史密森尼国家自然历史博物馆Huai-Hsuan M. Huang博士为论文的共同第一作者，合作者包括香港大学洪媛媛博士和Skye Yunshu Tian博士，中国地质调查局青岛海洋地质研究所刘健研究员、陈建文研究员和梁杰正高级工程师，以及韩国首尔大学Yong Il Lee教授。
本项研究得到江苏省自然科学基金、现代古生物学和地层学国家重点实验室开放课题、国家自然科学基金以及中国地质调查局项目等共同资助。
论文相关信息：Zhang, P., Huang, H.-H. M., Hong, Y., Tian, S. Y., Liu, J., Lee, Y., et al. (2022). Southward migration of Arctic Ocean species during the Last Glacial Period. Geophysical Research Letters, 49, e2022GL100818. https://doi.org/10.1029/2022GL100818.
图1 本研究报道的黄海和日本海站位的分布图
图2 本次研究发现的北极介形虫分布范围以及生活环境
图3 北极介形虫在黄海钻孔和日本海站位中的分布对比图2022-11-18