自然指数有三种计量方法来追踪作者的单位信息：论文计数(article count/AC)-不论一篇文章有一个还是多个作者，每位作者所在的国家或机构都获得1个AC分值。分数式计量（fractional count/FC）-FC考虑的是每位论文作者的相对贡献。一篇文章的FC总分值为1，在假定每人的贡献是相同的情况下，该分值由所有作者平等共享。例如，一篇论文有十个作者，那每位作者的FC得分为0.1。如果作者有多个工作单位，那其个人FC分值将在这些工作单位中再进行平均分配。加权分数式计量（weighted fractional count/WFC）-即为FC增加权重，以调整占比过多的天文学和天体物理学论文。

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　　《自然》和《科学》两刊发表论文前25强 

2014	机构名称	WFC 2013	WFC 2014	AC 2014	2013-14年WFC变化
1	北京大学	4.10	6.48	28	58.00%
2	清华大学	5.43	4.90	20	–9.8%
3	BGI	1.78	2.84	14	59.10%
4	中科院上海生命科学院	5.44	2.70	10	–50.4%
5	中科院生物物理所	0.13	2.56	7	1856.60%
6	浙江大学	1.70	2.19	8	28.90%
7	北京生命科学研究所NIBS	1.12	2.11	4	87.30%
8	中科院大连化物所	0.89	1.56	4	75.70%
9	中国科学院大学	0.50	1.20	7	138.50%
10	中国海洋大学	0.17	1.17	3	600.00%
11	中科院物理所	0.95	1.12	5	18.00%
12	华中科技大学	0.05	0.92	1	1733.30%
13	中科院上海有机所		0.92	1
14	燕山大学	0.73	0.82	1	11.60%
15	中国科技大学	1.69	0.82	7	–51.6%
16	哈尔滨工业大学	0.07	0.80	1	1020.00%
17	中国国家基因库(CNGB)		0.64	7
18	第二军医大学		0.64	3
19	南京大学	0.05	0.58	2	1008.30%
20	中国农科院	2.84	0.56	5	–80.5%
21	上海交通大学	0.18	0.54	1	193.10%
22	中科院南京地质古生物所	0.75	0.53	2	–29.5%
23	中国医学科学院（协和）	0.13	0.53	3	322.50%
24	云南大学	0.80	0.50	1	–37.5%
25	中科院海洋所		0.50	1