该时期，古生物研究所在各种学术刊物上发表论文220余篇，出版专著近50部，如《中国各门类化石》、《中国古生物志》（新甲种、新乙种）、《古生物学丛书》、《扬子区标准化石手册》、《西北区标准化石手册》和《华南区标准化石手册》等。此外，还创办了《中国科学院古生物研究所集刊》。 

　　由古生物研究所卢衍豪、穆恩之等负责编著的《中国各门类化石》系列丛书的出版，是古生物学研究的第一个里程碑。该书系统总结了中国古生物学近百年的研究成果，详尽记述了各门类化石的时空分布，厘定了分类单元，为我国古生物学的发展和提升奠定了基础，对全国区域地质测量、矿产普查勘探和含矿地层时代的确定等起到了指导作用。 

　　该丛书于1982年荣获国家自然科学奖二等奖，穆恩之、杨敬之、盛金章、侯佑堂等获奖。