祁连山是我国西部的重要山系之一。1956-1958年，由中国科学院地质研究所、兰州地质研究所、古生物研究所和北京地质学院等为主体的祁连山地质队，对祁连山的地质情况进行了全面调查。其中，古生物研究所穆恩之等8位科研人员主要承担古生物学及地层学的专题研究任务。 

　　此次考察初步建立了祁连山从前寒武系到第三系的地层层序和古生界—中生界生物组合系列，同时对其石炭系、三叠系煤系地层和中新生代含油气地层开展了初步划分对比。 

　　1960-1964年，古生物研究所斯行健、穆恩之、张文堂等对该地区地层和古生物化石做了相关研究，与兄弟单位合作编著了《祁连山地质志》四卷。研究成果对西北地区古生物、地层乃至地质学研究都产生了深远的影响。 

穆恩之在祁连山采集的化石标本及标签